BYK-50型微波治疗仪采用经尿道对病灶部位进行加热的体内疗法，微波能量对病灶部位的加热使之达到比体温高的温度一般为38-43°C ，使血流量增加，血液中机体免疫细胞浸润，使附着尿道粘膜处的病原微生物在高温作用下死亡，病变组织变性、萎缩、脱落，从而提高了机体组织的抗病能力，达到治疗目的。